Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShdO88834 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ShdO88834 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShdO88834 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShdO88834 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ShdO88834 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShdO88834 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShdO88834 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShdO88834 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms