Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ComtO88587 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ComtO88587 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ComtO88587 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ComtO88587 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ComtO88587 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ComtO88587 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ComtO88587 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ComtO88587 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms