Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CntfrO88507 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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CntfrO88507 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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CntfrO88507 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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