Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms