Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xirp1O70373 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms