Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms