Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChkbO55229 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms