Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlx3O55144 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms