Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrxO55103 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrxO55103 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrxO55103 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrxO55103 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrxO55103 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrxO55103 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrxO55103 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms