Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms