Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb2O55029 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms