Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms