Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6bO54951 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6bO54951 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms