Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DffaO54786 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DffaO54786 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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DffaO54786 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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DffaO54786 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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DffaO54786 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DffaO54786 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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