Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r2O35926 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdk5r2O35926 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdk5r2O35926 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdk5r2O35926 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms