Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfibp2O35711 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms