Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn6O35646 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms