Protein–RNA interactions for Protein: O35601

Fyb1, FYN-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyb1O35601 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fyb1O35601 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fyb1O35601 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fyb1O35601 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fyb1O35601 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fyb1O35601 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fyb1O35601 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms