Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc1a6O35544 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms