Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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TnxbO35452 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TnxbO35452 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms