Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms