Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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