Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxd2O35392 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms