Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf5O35326 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf5O35326 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms