Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc16a8O35308 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc16a8O35308 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms