Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn9O35239 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Ptpn9O35239 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms