Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe40O35185 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms