Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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