Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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