Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap23O09044 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms