Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
U90926O08546 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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U90926O08546 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
U90926O08546 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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U90926O08546 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms