Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20939L7N243 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms