Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm379J3QQ19 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm379J3QQ19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm379J3QQ19 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm379J3QQ19 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm379J3QQ19 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm379J3QQ19 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm379J3QQ19 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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