Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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