Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms