Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mfsd4b4J3QNS5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms