Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms