Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6408J3QNG1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm6408J3QNG1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6408J3QNG1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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