Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6594J3QM43 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms