Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930544D05RikJ3QK56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms