Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
7530416G11RikJ3QJX6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms