Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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