Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdye4cI6XKQ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms