Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms