Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms