Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms