Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf148G3X9R7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf148G3X9R7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms