Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r39G3UWE6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r39G3UWE6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms