Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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