Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms